70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2504 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 69 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  86.15 
 
 		 72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  73.85 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  60.32 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  52.24 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  55.56 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  48.48 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.25 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  52.31 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.69 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  51.47 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.77 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.77 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.77 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  50.77 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  51.52 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  49.23 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.31 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  50.77 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  48.44 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  52.38 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50.79 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  49.21 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  49.21 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.15 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  43.42 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  44.74 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.21 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  45.59 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  53.57 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.38 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  42.67 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  41.43 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 76 aa  57  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  31.94 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  33.85 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  34.92 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  41.07 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  35.29 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  33.82 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  27.94 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  34.85 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.38 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  44.9 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  27.69 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 59 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 71 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  30.77 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  23.53 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  34.43 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  35.85 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.26 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>