52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3914 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
79 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  81.58 
 
 
78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  76.71 
 
 
76 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  73.61 
 
 
78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  65.75 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  68.06 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  46.84 
 
 
72 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.87 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  44.74 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
73 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  52.78 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.95 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  49.3 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  50.68 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  47.95 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.48 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  46.48 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.48 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  46.48 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.04 
 
 
72 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  49.32 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.32 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.32 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.95 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  39.73 
 
 
69 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  39.73 
 
 
69 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  45.07 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  40.85 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  43.66 
 
 
81 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  47.22 
 
 
68 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.28 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  41.1 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  43.66 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  43.66 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  43.04 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.83 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  49.21 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  38.67 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4828  putative tautomerase  47.83 
 
 
47 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  35.9 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.62 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  34.92 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  36.11 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  46 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.91 
 
 
63 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>