107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0200 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  58.62 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  48.33 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  50 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  48.39 
 
 		 72 aa  60.1  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  45.16 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.16 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.39 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  43.55 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.21 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  43.55 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  48.21 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  48.21 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  48.33 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.32 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  45.28 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  48.33 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  48.33 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  43.33 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  47.62 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  44.07 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.43 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  39.71 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.27 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  34.38 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  41.38 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 63 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>