32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2180 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  66.13 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 
61 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  55.74 
 
 
64 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1055  4-oxalocrotonate tautomerase  50.82 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1542  4-oxalocrotonate tautomerase  55.93 
 
 
66 aa  57  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000358699  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0719  4-oxalocrotonate tautomerase  50.91 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.5068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0159  4-oxalocrotonate tautomerase  50.91 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0523793 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0009  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0079  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  46.77 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000137411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.15 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2976  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.854525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  32.81 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1332  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
71 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000185416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>