103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0823 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  90.32 
 
 
62 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  82.26 
 
 
62 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  75.81 
 
 
62 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  69.35 
 
 
62 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  72.13 
 
 
62 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  72.13 
 
 
62 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  72.13 
 
 
62 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  70.97 
 
 
62 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  75.41 
 
 
62 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  70.97 
 
 
63 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  75.41 
 
 
62 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  72.58 
 
 
62 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  69.35 
 
 
62 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  67.21 
 
 
62 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  70.97 
 
 
62 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  70.97 
 
 
62 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  70.97 
 
 
63 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  71.67 
 
 
61 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  66.13 
 
 
63 aa  95.9  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  68.33 
 
 
61 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  54.1 
 
 
63 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  56.14 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.33 
 
 
61 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 
61 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.26 
 
 
62 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.32 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.98 
 
 
69 aa  53.9  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  42.86 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
61 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
61 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
68 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.15 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
61 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  37.5 
 
 
69 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
71 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 
65 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  34.55 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  29.03 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  38.78 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.84 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3425  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  28.33 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0086  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.75 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.71 
 
 
67 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3195  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  26.67 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3448  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  26.67 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
59 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  42.22 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  35.29 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>