75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6264 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
63 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 
62 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
62 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
62 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
62 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.32 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
62 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
61 aa  50.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
58 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  34.43 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  27.42 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.84 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.36 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.87 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.15 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
80 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.67 
 
 
61 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  30.91 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  27.42 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  37.1 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  30.51 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  30.36 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.36 
 
 
63 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.36 
 
 
63 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>