45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0702 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  100 
 
 
61 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  68.85 
 
 
62 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  70.49 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  68.85 
 
 
61 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 
61 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
59 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.64 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05436  hypothetical protein  39.34 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 
69 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 
64 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17651  ATLS1-like light-inducible protein  35.85 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  36.36 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>