121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0732 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  95.59 
 
 		 76 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  77.94 
 
 		 71 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  81.82 
 
 		 66 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  81.82 
 
 		 66 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  80.3 
 
 		 66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  80.6 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  73.13 
 
 		 67 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  76.12 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  76.12 
 
 		 68 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  69.12 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.88 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  75.38 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  70.15 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  67.16 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  71.88 
 
 		 65 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  76.19 
 
 		 72 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  71.64 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  72.31 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  64.71 
 
 		 69 aa  93.6  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  73.44 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  75 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  72.73 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  75 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  75 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  64.71 
 
 		 73 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  64.06 
 
 		 71 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  58.82 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  70.77 
 
 		 74 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  65.08 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  57.35 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  58.57 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  59.09 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  59.09 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  59.38 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  55.84 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  54.05 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  53.12 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  54.69 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  53.12 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  53.62 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  52.86 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  52.11 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  50.65 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  47.89 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  46.48 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.16 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  46.77 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  43.28 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  32.84 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  38.24 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  39.68 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  41.94 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  38.1 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.29 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.55 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  31.75 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.32 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.32 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  33.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  40.98 
 
 		 72 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 70 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 63 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>