103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4872 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
61 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  90.16 
 
 
61 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 
62 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 
62 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 
62 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 
62 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  78.33 
 
 
62 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  79.66 
 
 
62 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  76.67 
 
 
62 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  70 
 
 
62 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  71.67 
 
 
62 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  71.67 
 
 
62 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  68.33 
 
 
62 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  65 
 
 
62 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 
63 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  63.33 
 
 
62 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  56.67 
 
 
63 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  65 
 
 
62 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 
62 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  65 
 
 
62 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  58.33 
 
 
62 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 
63 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.67 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 
61 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  42.86 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
63 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.82 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.82 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  41.82 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 
59 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  35.59 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3425  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  31.15 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.55 
 
 
63 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
63 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3195  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  29.51 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3448  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  29.51 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  38.18 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05436  hypothetical protein  33.33 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  37.74 
 
 
60 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.19 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
62 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
62 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  37.5 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.14 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.14 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0235  4-oxalocrotonate tautomerase  37.04 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  40.38 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>