28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3030 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
67 aa  130  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  54.1 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0159  4-oxalocrotonate tautomerase  50.82 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0523793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0719  4-oxalocrotonate tautomerase  50.82 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.5068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  53.7 
 
 
61 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 
61 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1055  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0009  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 
63 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1542  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000358699  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  38.33 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  34.33 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.43 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1332  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000185416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0079  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000137411  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  34.33 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2976  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.854525 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.51 
 
 
68 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  34.33 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  29.23 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5861  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.51 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  33.85 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.566726  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>