59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2408 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
70 aa  142  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  91.43 
 
 
70 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  60 
 
 
71 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.62 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.35 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.92 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1186  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.13377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  34.55 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  33.33 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2159  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
64 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
63 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  29.23 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  27.42 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
67 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  29.82 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  29.82 
 
 
63 aa  44.3  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.65 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.54 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.54 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>