114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01664 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 70 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  64.41 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  55.36 
 
 		 63 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  51.67 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  57.14 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  49.15 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  52.73 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  51.79 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  51.79 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  48.21 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  59.62 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  47.46 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  52.73 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  44.07 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  44.07 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  49.09 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  42.37 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.45 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  42.37 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  43.64 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.27 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  46.15 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  44.62 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  46.15 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  34.33 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2159  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.51 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.68 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0235  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  34.55 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  45.1 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.94 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  40.43 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2951  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0086  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  35.59 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 		 60 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  33.96 
 
 		 129 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 72 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.93 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 		 62 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 		 62 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.29 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>