82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1066 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 61 aa  123  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  50.82 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  43.86 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  49.18 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  45.9 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  45.9 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.33 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  40 
 
 		 69 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  36.36 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  26.67 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2159  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  32.79 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30 
 
 		 71 aa  41.2  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1055  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  24.59 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  26.23 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>