33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3810 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 144 aa  286  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0235  4-oxalocrotonate tautomerase  28.24 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  26.98 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  26.98 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.68 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.68 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  24.6 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.85 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  26.19 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.84 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  34.85 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  34.55 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.29 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  21.92 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>