96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3323 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  55.74 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.62 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.71 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.76 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.64 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  41.38 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.23 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  41.07 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  43.1 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3425  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.2 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.21 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  34.48 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.21 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 61 aa  47.4  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  34.48 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.29 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  28.99 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3448  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.2 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3195  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.2 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1082  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.121221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0086  4-oxalocrotonate tautomerase  33.85 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.03 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  27.54 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2951  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  31.82 
 
 		 67 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  29.09 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  40.3 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  28.36 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>