31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0235 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0235  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 138 aa  270  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  28.24 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.62 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  30.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.38 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.38 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  28.1 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  41.38 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  28.1 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  34.48 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  37.04 
 
 		 62 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  37.04 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  37.04 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  37.04 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  37.04 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 63 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>