40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5353 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 128 aa  244  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  96.09 
 
 		 146 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  95.31 
 
 		 128 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  94.53 
 
 		 128 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  92.19 
 
 		 128 aa  231  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  93.75 
 
 		 128 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  80.47 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  71.09 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 63 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  44.44 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.68 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  46.55 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  46.55 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  38.1 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  50.91 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  46.15 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.1 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.1 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0235  4-oxalocrotonate tautomerase  28.1 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  30.65 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  26.19 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  32.73 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.71 
 
 		 71 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.25 
 
 		 77 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.36 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  35.09 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>