61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1481 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  54.39 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.44 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  53.33 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  49.09 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.61 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  42.37 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  45.16 
 
 
69 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.44 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  52.46 
 
 
63 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  43.86 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.33 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.37 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  44.83 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  38.18 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
63 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  29.23 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  29.23 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  36.36 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 
69 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
61 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  38.89 
 
 
128 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>