60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08690 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 60 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 		 63 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  59.32 
 
 		 63 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  54.24 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  54.24 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  54.24 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  52.54 
 
 		 63 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  54.24 
 
 		 63 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  54.24 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  54.24 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  49.15 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  51.79 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.54 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  52.54 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  51.79 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  59.62 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  44.64 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.76 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.08 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  40.68 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.74 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.59 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  44.83 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  43.14 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  42.59 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  37.74 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  43.48 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  45.83 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  33.96 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  35.85 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  35.85 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  33.96 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  30.77 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  37.25 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  33.96 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  32.08 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>