43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1084 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
61 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  90 
 
 
60 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  56.67 
 
 
61 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  44.83 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 
61 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  41.18 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  41.82 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  43.14 
 
 
64 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.81 
 
 
64 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  37.25 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  29.82 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.73 
 
 
63 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>