63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0740 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
59 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  43.86 
 
 
61 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  52.73 
 
 
61 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  49.09 
 
 
62 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  49.09 
 
 
62 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  45.76 
 
 
61 aa  60.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
61 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  44.83 
 
 
60 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  44.83 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
61 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  40 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.68 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.5 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  38.98 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.73 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  27.12 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
69 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.93 
 
 
73 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0086  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  28.57 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.48 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.48 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.91 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2159  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1186  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.13377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>