52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1079 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
60 aa  124  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  90 
 
 
61 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  55 
 
 
61 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  44.83 
 
 
59 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  47.27 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  43.14 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
61 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
63 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
70 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
58 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  32.73 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.91 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  29.82 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.82 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  27.59 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
69 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>