97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6046 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  100 
 
 		 64 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.26 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.26 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  46.43 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.62 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  43.86 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  45.61 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 58 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2264  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.363354 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 63 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  35.94 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  42.55 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  35.94 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  33.85 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  33.85 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  35.38 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  33.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  32.31 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  32.81 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1082  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.121221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.71 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  35.29 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  30.77 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  32 
 
 		 124 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3425  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  25 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  25 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  38.3 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3448  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  25 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3195  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  25 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  29.82 
 
 		 60 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>