38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2158 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
127 aa  251  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  72.66 
 
 
146 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  71.09 
 
 
128 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  71.09 
 
 
128 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  70.31 
 
 
128 aa  163  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  69.53 
 
 
128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  68.75 
 
 
128 aa  159  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  65.62 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  53.57 
 
 
63 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
60 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  50.88 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.11 
 
 
63 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  38.6 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 
70 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 
186 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
70 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  36.92 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.09 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.1 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.71 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.73 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
63 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>