78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  100 
 
 
69 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  58.18 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  45.16 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.09 
 
 
61 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 
60 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
63 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.32 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.35 
 
 
63 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.45 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  38.6 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  36.92 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
62 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.35 
 
 
63 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40.35 
 
 
63 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
62 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.48 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  30.91 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  35.59 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
61 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>