37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3763 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
186 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0693  4-oxalocrotonate tautomerase  53.01 
 
 
191 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4455  putative inner membrane protein  43.36 
 
 
131 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4343  hypothetical protein  42.48 
 
 
131 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000651176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4303  hypothetical protein  42.48 
 
 
131 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4274  hypothetical protein  42.48 
 
 
131 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587714  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4387  hypothetical protein  42.48 
 
 
131 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2166  hypothetical protein  39.47 
 
 
132 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3302  hypothetical protein  38.39 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3838  hypothetical protein  38.05 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2080  hypothetical protein  37.17 
 
 
149 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2165  hypothetical protein  36.51 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4854  hypothetical protein  36.61 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1965  hypothetical protein  36.7 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5341  hypothetical protein  35.71 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.841144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3604  hypothetical protein  37.5 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266316  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0430  hypothetical protein  34.75 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 
127 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
63 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
63 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  38.96 
 
 
128 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
80 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  38.96 
 
 
128 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
128 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  30.91 
 
 
63 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  42.86 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
63 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  30.91 
 
 
63 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.55 
 
 
69 aa  41.6  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.84 
 
 
62 aa  41.6  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  33.96 
 
 
60 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.58 
 
 
69 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
128 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1096  hypothetical protein  44.19 
 
 
125 aa  40.8  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
65 aa  40.8  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>