18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4854 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4854  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5341  hypothetical protein  97.79 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.841144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1965  hypothetical protein  93.38 
 
 		 136 aa  240  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3302  hypothetical protein  86.82 
 
 		 138 aa  230  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2080  hypothetical protein  72.44 
 
 		 149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3604  hypothetical protein  70 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266316  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2165  hypothetical protein  70.63 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0430  hypothetical protein  61.29 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3838  hypothetical protein  56.78 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2166  hypothetical protein  52.67 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4455  putative inner membrane protein  51.61 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4343  hypothetical protein  50.81 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000651176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4303  hypothetical protein  50.81 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4274  hypothetical protein  50.81 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4387  hypothetical protein  50.81 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0693  4-oxalocrotonate tautomerase  41.32 
 
 		 191 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  36.61 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1096  hypothetical protein  32.46 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>