18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2080 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2080  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3302  hypothetical protein  72.09 
 
 		 138 aa  194  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4854  hypothetical protein  72.44 
 
 		 136 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5341  hypothetical protein  71.65 
 
 		 136 aa  193  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.841144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1965  hypothetical protein  74.79 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3604  hypothetical protein  72.73 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266316  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2165  hypothetical protein  70.77 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0430  hypothetical protein  61.6 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4455  putative inner membrane protein  56 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2166  hypothetical protein  56.8 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4343  hypothetical protein  55.2 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000651176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4387  hypothetical protein  55.2 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4274  hypothetical protein  55.2 
 
 		 131 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4303  hypothetical protein  55.2 
 
 		 131 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3838  hypothetical protein  57.14 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0693  4-oxalocrotonate tautomerase  39.17 
 
 		 191 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  37.17 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1096  hypothetical protein  37.07 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>