16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1096 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3838  hypothetical protein  42.11 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0430  hypothetical protein  35.43 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2080  hypothetical protein  37.07 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2166  hypothetical protein  37.89 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0693  4-oxalocrotonate tautomerase  31.36 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4343  hypothetical protein  42.67 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000651176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4387  hypothetical protein  42.67 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4274  hypothetical protein  42.67 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4303  hypothetical protein  42.67 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4455  putative inner membrane protein  41.33 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4854  hypothetical protein  32.46 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3302  hypothetical protein  34.48 
 
 		 138 aa  42  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1965  hypothetical protein  31.53 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5341  hypothetical protein  30.7 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.841144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  44.19 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>