19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0693 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0693  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  53.01 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4854  hypothetical protein  41.32 
 
 		 136 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2080  hypothetical protein  39.17 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5341  hypothetical protein  41.32 
 
 		 136 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.841144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4455  putative inner membrane protein  41.44 
 
 		 131 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3302  hypothetical protein  41.23 
 
 		 138 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4303  hypothetical protein  40.54 
 
 		 131 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3604  hypothetical protein  40.16 
 
 		 133 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266316  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4343  hypothetical protein  40.54 
 
 		 131 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000651176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4387  hypothetical protein  40.54 
 
 		 131 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4274  hypothetical protein  40.54 
 
 		 131 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1965  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3838  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2165  hypothetical protein  38.71 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2166  hypothetical protein  37.93 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0430  hypothetical protein  35.2 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1096  hypothetical protein  31.36 
 
 		 125 aa  48.9  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 		 80 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>