18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4455 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4455  putative inner membrane protein  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4343  hypothetical protein  98.47 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000651176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4387  hypothetical protein  98.47 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4274  hypothetical protein  97.71 
 
 		 131 aa  263  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4303  hypothetical protein  97.71 
 
 		 131 aa  263  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2166  hypothetical protein  66.41 
 
 		 132 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3838  hypothetical protein  64.12 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2080  hypothetical protein  56 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3604  hypothetical protein  52.34 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266316  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4854  hypothetical protein  51.61 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5341  hypothetical protein  50.81 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.841144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3302  hypothetical protein  53.85 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2165  hypothetical protein  53.17 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1965  hypothetical protein  53.57 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0430  hypothetical protein  50.85 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  43.36 
 
 		 186 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0693  4-oxalocrotonate tautomerase  41.44 
 
 		 191 aa  88.2  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1096  hypothetical protein  41.33 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>