17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2165 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2165  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3604  hypothetical protein  89.39 
 
 		 133 aa  238  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266316  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2080  hypothetical protein  70.77 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4854  hypothetical protein  70.63 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3302  hypothetical protein  68.7 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5341  hypothetical protein  69.84 
 
 		 136 aa  176  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.841144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1965  hypothetical protein  73.45 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0430  hypothetical protein  62.5 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2166  hypothetical protein  57.6 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3838  hypothetical protein  56.1 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4274  hypothetical protein  52.76 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4303  hypothetical protein  52.76 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4455  putative inner membrane protein  53.17 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4343  hypothetical protein  52.76 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000651176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4387  hypothetical protein  52.76 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0693  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>