51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2498 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2498  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
128 aa  248  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0252029  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3523  4-oxalocrotonate tautomerase  92.19 
 
 
128 aa  231  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0522964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5353  4-oxalocrotonate tautomerase  92.19 
 
 
128 aa  231  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167902  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3617  4-oxalocrotonate tautomerase  92.19 
 
 
128 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629202  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  92.19 
 
 
146 aa  229  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  91.41 
 
 
128 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.87442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  78.91 
 
 
149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2158  4-oxalocrotonate tautomerase  71.09 
 
 
127 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  49.21 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  44.44 
 
 
63 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  48.28 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
60 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.1 
 
 
63 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  44.83 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 
63 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
63 aa  53.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  47.69 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 
69 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.1 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.1 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0235  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3810  4-oxalocrotonate tautomerase  26.98 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.84 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3763  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.66 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  32.73 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  36.84 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
68 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.71 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>