37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1139 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  50.88 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  50.88 
 
 
62 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 
63 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  50.88 
 
 
61 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  43.86 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  43.55 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  45.61 
 
 
62 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  45.61 
 
 
62 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  45.61 
 
 
62 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  46.77 
 
 
62 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  43.86 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 
61 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.6 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.58 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 
59 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>