42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2946 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 86 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  77.42 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 		 60 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  72.88 
 
 		 59 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05436  hypothetical protein  73.85 
 
 		 65 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  54.35 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  40 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  32.14 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  26.67 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.73 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 61 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.51 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>