61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0208 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 59 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  76.27 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  72.88 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  72.41 
 
 		 60 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05436  hypothetical protein  72.88 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  40.35 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.73 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  29.09 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  29.09 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  27.12 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 		 61 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  29.09 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.09 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  32.76 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1805  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>