44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0443 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
60 aa  123  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  75 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  72.41 
 
 
59 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05436  hypothetical protein  76.67 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  45.65 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  29.09 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  29.09 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.82 
 
 
64 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
62 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
61 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>