55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1634 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
58 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.64 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  43.14 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  43.14 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  47.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.71 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.21 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  40.38 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
61 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  43.5  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  36.36 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  44.19 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  29.31 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  34.55 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
60 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.18 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>