59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0020 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
61 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  52.46 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  46.67 
 
 
62 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 
62 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 
62 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.84 
 
 
69 aa  57.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1082  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 
62 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.121221  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  40.68 
 
 
59 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.84 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 
62 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
60 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 
62 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.43 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  26.67 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0702  putative isomerase  36.67 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.995375  normal  0.17203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  28.33 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
61 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  29.09 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  30.36 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
63 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>