60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6731 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
76 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1349  4-oxalocrotonate tautomerase  63.16 
 
 
76 aa  106  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.667295  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  64 
 
 
76 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 
78 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  54.05 
 
 
79 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  52.05 
 
 
75 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  52.05 
 
 
75 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2242  hypothetical protein  62.22 
 
 
49 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1696  hypothetical protein  44.26 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.15038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2353  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1713  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  0.0298053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2057  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2084  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2195  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 
75 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1642  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 
75 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1545  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 
75 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.773724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2070  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 
75 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2186  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 
77 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00899625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01419  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 
75 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1864  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.819368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1780  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 
76 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0393744  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  30.99 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
62 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  40.38 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.54 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  35.85 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.48 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  30.77 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.69 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>