35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2511 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
79 aa  159  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  64.38 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  63.01 
 
 
75 aa  94.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 
80 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  54.05 
 
 
76 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1349  4-oxalocrotonate tautomerase  51.35 
 
 
76 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.667295  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  48.72 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  47.3 
 
 
76 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2084  4-oxalocrotonate tautomerase  39.19 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1780  4-oxalocrotonate tautomerase  41.89 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0393744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1713  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  0.0298053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2057  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106569  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2186  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00899625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2070  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2195  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1642  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01419  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1545  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.773724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1864  4-oxalocrotonate tautomerase  39.19 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.819368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2353  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 
76 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2242  hypothetical protein  46.81 
 
 
49 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1696  hypothetical protein  40.98 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.15038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  40.38 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>