22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2353 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2353  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 76 aa  157  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2057  4-oxalocrotonate tautomerase  93.42 
 
 		 76 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2084  4-oxalocrotonate tautomerase  54.67 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1780  4-oxalocrotonate tautomerase  50.67 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0393744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1864  4-oxalocrotonate tautomerase  50.67 
 
 		 76 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.819368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1713  4-oxalocrotonate tautomerase  49.33 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  0.0298053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2186  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00899625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1545  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.773724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1642  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2195  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2070  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01419  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  48.65 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  45.95 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  40.54 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 		 79 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1349  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.667295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1696  hypothetical protein  26.76 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.15038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2242  hypothetical protein  39.13 
 
 		 49 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>