49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2370 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
76 aa  154  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  64 
 
 
76 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1349  4-oxalocrotonate tautomerase  66.67 
 
 
76 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.667295  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  49.32 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  47.95 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  47.3 
 
 
79 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  44.62 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2242  hypothetical protein  54.35 
 
 
49 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2353  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2057  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1780  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0393744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2084  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1713  4-oxalocrotonate tautomerase  31.08 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  0.0298053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1864  4-oxalocrotonate tautomerase  31.08 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.819368  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2186  4-oxalocrotonate tautomerase  29.73 
 
 
77 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00899625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01419  4-oxalocrotonate tautomerase  29.73 
 
 
75 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1545  4-oxalocrotonate tautomerase  29.73 
 
 
75 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.773724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1642  4-oxalocrotonate tautomerase  29.73 
 
 
75 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2195  4-oxalocrotonate tautomerase  29.73 
 
 
75 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2070  4-oxalocrotonate tautomerase  29.73 
 
 
75 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.22 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1696  hypothetical protein  29.51 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.15038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  42.31 
 
 
63 aa  42  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  31.37 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  31.37 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  35.29 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  35.29 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  37.25 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  37.25 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  40.38 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  31.37 
 
 
62 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  31.37 
 
 
62 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  31.37 
 
 
62 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>