47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0652 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  56.76 
 
 
75 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  55.41 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1349  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 
76 aa  80.1  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.667295  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  53.03 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  48.72 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1780  4-oxalocrotonate tautomerase  41.89 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0393744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2353  4-oxalocrotonate tautomerase  40.54 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2084  4-oxalocrotonate tautomerase  40.54 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2242  hypothetical protein  48.98 
 
 
49 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1864  4-oxalocrotonate tautomerase  40.54 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.819368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2057  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1713  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  0.0298053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2195  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2070  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2186  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00899625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1642  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1545  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.773724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01419  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  43.14 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.22 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  40.38 
 
 
58 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.54 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  37.25 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  45.1 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  39.22 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.25 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  35.29 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.29 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.54 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.18 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  35.29 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>