14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2242 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2242  hypothetical protein  100 
 
 		 49 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  62.22 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  54.35 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  48.98 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  54.76 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1349  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.667295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  46.81 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1696  hypothetical protein  41.3 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.15038 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2057  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2353  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 		 76 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1864  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.819368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2084  4-oxalocrotonate tautomerase  41.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>