21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1713 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1713  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 75 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  0.0298053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2186  4-oxalocrotonate tautomerase  97.33 
 
 		 77 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00899625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2195  4-oxalocrotonate tautomerase  97.33 
 
 		 75 aa  150  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2070  4-oxalocrotonate tautomerase  97.33 
 
 		 75 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01419  4-oxalocrotonate tautomerase  97.33 
 
 		 75 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1642  4-oxalocrotonate tautomerase  97.33 
 
 		 75 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1545  4-oxalocrotonate tautomerase  97.33 
 
 		 75 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.773724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2084  4-oxalocrotonate tautomerase  69.74 
 
 		 76 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1864  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 76 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.819368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1780  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0393744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2353  4-oxalocrotonate tautomerase  49.33 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2057  4-oxalocrotonate tautomerase  48 
 
 		 76 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  35.14 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  35.53 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  33.78 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  35.53 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  31.08 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1349  4-oxalocrotonate tautomerase  31.08 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.667295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1696  hypothetical protein  35.21 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.15038 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>