26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0911 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  88.06 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  85.07 
 
 		 67 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  83.58 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1186  4-oxalocrotonate tautomerase  82.09 
 
 		 67 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.13377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.81 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2036  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.68 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  36.84 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>