30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1368 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
67 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1186  4-oxalocrotonate tautomerase  95.52 
 
 
67 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.13377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  91.04 
 
 
67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  88.06 
 
 
67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  83.58 
 
 
67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.67 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.31 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
62 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
59 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.3 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 
62 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>