38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1290 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 67 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  88.06 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  91.04 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1186  4-oxalocrotonate tautomerase  89.55 
 
 		 67 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.13377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  89.55 
 
 		 67 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.31 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3818  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275708  normal  0.0206899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.43 
 
 		 69 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 62 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.51 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.87 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  44 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  36.36 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 63 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>