33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8512 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  58.59 
 
 
127 aa  155  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  56.25 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  51.59 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  44.19 
 
 
129 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  38.58 
 
 
128 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  38.58 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  37.8 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  48.39 
 
 
62 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  44.12 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.45 
 
 
244 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  29.6 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  30.28 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  30.43 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  24.07 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  24.07 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  25 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  25 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  25 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  27.45 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
70 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
64 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  21.67 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  39.62 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  24.17 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  32.2 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  33.9 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  21.55 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  26.92 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  38.89 
 
 
65 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>